Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFDP1Q9UEE9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms