Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms