Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL2Q9UBQ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms