Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms