Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms