Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms