Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms