Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC2Q9P258 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms