Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms