Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREM2Q9NZC2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms