Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms