Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms