Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK13-1Q9NX77 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms