Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms