Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms