Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms