Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms