Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HMG20AQ9NP66 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMG20AQ9NP66 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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