Protein–RNA interactions for Protein: Q9H999

PANK3, Pantothenate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK3Q9H999 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK3Q9H999 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms