Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
YTHDC2Q9H6S0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC2Q9H6S0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms