Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms