Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNKL1Q9BZJ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms