Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BARHL1Q9BZE3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms