Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms