Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PECRQ9BY49 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms