Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms