Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS2Q9BXC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms