Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA5Q9BWX5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms