Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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