Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF4Q9BUZ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms