Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM208Q9BTX3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms