Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRACR2AQ9BSW2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms