Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms