Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms