Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms