Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms