Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms