Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms