Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DCHS1Q96JQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms