Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms