Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMD4Q96H15 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms