Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms