Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms