Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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