Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms