Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4CQ96CF2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms