Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APH1AQ96BI3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms