Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms