Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms