Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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GTF3C6Q969F1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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GTF3C6Q969F1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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